Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3FO00303 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF3FO00303 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms