Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3B1O00203 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP3B1O00203 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B1O00203 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms