Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN8O00124 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms