Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01387J3KSC0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms