Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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