Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX16-NPEPL1H3BU86 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms