Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8VP50 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
F8VP50 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8VP50 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8VP50 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8VP50 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
F8VP50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8VP50 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8VP50 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8VP50 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8VP50 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8VP50 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
F8VP50 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms