Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CENPBD1B2RD01 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPBD1B2RD01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms