Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF487B1APH4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms