Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
A8MVJ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
A8MVJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
A8MVJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
A8MVJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
A8MVJ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
A8MVJ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
A8MVJ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
A8MVJ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
A8MVJ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
A8MVJ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms