Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC85CA6NKD9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC85CA6NKD9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms