Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB15A6NHN6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB15A6NHN6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB15A6NHN6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms