Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1LA6NFU8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms