Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C5orf60A6NFR6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C5orf60A6NFR6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms