Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00862A6NCI5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms