Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRBA1A5PL33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRBA1A5PL33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms