Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS37CA5D8V6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS37CA5D8V6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms