Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC162PA2VCL2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms