Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC66A2RUB6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC66A2RUB6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms