Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCE3A1L190 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms