Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM223A0PJW6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms