Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YY99 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YY99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YY99 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YY99 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YY99 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YY99 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0J9YY99 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms