Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 CDH5-208ENST00000614547 3779 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ANKRD30BP2-202ENST00000447861 3260 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 FO681491.1-201ENST00000623586 3260 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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