Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 RIPK3-201ENST00000216274 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SPDYE8P-201ENST00000333385 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SPDYE11-201ENST00000340073 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SPDYE9P-203ENST00000575125 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 GIMAP6-201ENST00000328902 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
OPALINQ96PE5 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms