Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PTPRJQ12913 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PTPRJQ12913 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PTPRJQ12913 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PTPRJQ12913 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PTPRJQ12913 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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PTPRJQ12913 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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PTPRJQ12913 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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