Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGNL1Q0VF96 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms