Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCAP28676 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AP000894.1-201ENST00000584430 520 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 PHB-214ENST00000614445 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCAP28676 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 CETP-202ENST00000379780 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCAP28676 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms