Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SCG3Q8WXD2 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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