Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CTLA4-202ENST00000302823 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms