Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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PTPRJQ12913 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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