Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMPOP42166 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms