Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK8P49336 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK8P49336 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms