Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF132-201ENST00000254166 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NTM-203ENST00000374791 3040 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GBA-202ENST00000368373 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCT6P1-201ENST00000434500 1544 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FLJ40194-201ENST00000322227 2317 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PAX8-AS1-205ENST00000437551 2390 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM255A-204ENST00000440464 3172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF682-203ENST00000397165 3245 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM8-204ENST00000392863 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ADH6-201ENST00000237653 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP5-203ENST00000562212 3400 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OR13A1-201ENST00000374401 2574 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC27-202ENST00000368612 1765 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CACNB4-204ENST00000427385 1776 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MAMDC2-201ENST00000377182 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC122129.1-201ENST00000354746 1815 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED1-203ENST00000375722 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FOSB-201ENST00000353609 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM15-201ENST00000339020 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms