Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms