Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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