Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CHI3L2-202ENST00000369748 1468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HDAC8-201ENST00000373554 833 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC007652.1-201ENST00000441150 562 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HTR3D-204ENST00000453435 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 BTNL8-207ENST00000511704 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC104371.1-201ENST00000522077 797 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MEG3-223ENST00000524131 721 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC089987.1-202ENST00000641959 426 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL356414.1-201ENST00000379526 686 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CHN2-209ENST00000421775 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 RNA5SP40-201ENST00000517147 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 IFITM9P-201ENST00000535743 396 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 FAAP24-205ENST00000590281 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 TRPM8-202ENST00000355722 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ATRXP46100 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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