Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMPOP42166 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms