Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD30BP2-202ENST00000447861 3260 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FO681491.1-201ENST00000623586 3260 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms