Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC10-209ENST00000525998 1841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKOR2Q2VWA4 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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