Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NBR1Q14596 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms