Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RPS29P62273 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms