Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC068631.1-215ENST00000630331 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 C22orf31-201ENST00000216071 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 OR8J3-201ENST00000301529 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CAPSL-202ENST00000397367 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 BRCA1-226ENST00000591534 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYCNP04198 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYCNP04198 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms