Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RIPK3-201ENST00000216274 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC10-209ENST00000525998 1841 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GIMAP6-201ENST00000328902 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms