Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 THEMIS3P-201ENST00000416112 1586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ANGEL1-205ENST00000557179 1427 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HAND2-204ENST00000621866 1337 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 RN7SL732P-201ENST00000581157 300 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIRT1Q96EB6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms