Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms