Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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