Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms