Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GGCXP38435 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms