Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A3GALT2U3KPV4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A3GALT2U3KPV4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms