Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K4Q9Y6R4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MAP3K4Q9Y6R4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms